Everton FC ble stifet i 1878 under navnet St.Domingos FC, men allerede i oppstartsåret kom navnet Everton Football Club.
De første fire årene spilte Everton i Stanley Park, men i 1882 flyttet de til Priory Road. Her holdt Everton til i to år før de flyttet til Anfield i 1884.
Everton spilte fotball på Anfield frem til 1892, da den nye og den gang Englands største og flotteste stadion, Goodison Park sto ferdig.
Klubben markerte seg tidlig og har i all sin tid vært blant Englands største klubber.
Den største perioden hadde klubben på 80-tallet under manager Howard Kendall. Da vant Everton ligaen to ganger og tok et FA-Cup trofè hjem til Goodison. Høydepunktet var da klubben gikk helt til topps i Cupvinnercupen i 1985.